Это уравнение записано для одномерного случая и потенциальной энергии, равной нулю. Но электрон в атоме обладает отличной от нуля потенциальной энергией, зависящей от зарядов ядра и электрона и от расстояния между ними.

В этом уравнении потенциальная энергия равна нулю, а электрон, находясь в поле ядра, обладает потенциальной энергией, зависящей от зарядов ядра и электрона и от расстояния между ними.

Обратите внимание на то, что это уравнение записано для одномерного случая, а выражение для потенциальной энергии соответствует гармоническому осциллятору.